للحفاظ على عنصر الأمان ونظراً لمحدودية الاحتفاظ بالبيانات، وفي سبيل حماية خصوصية المستخدمين للتطبيق، تقوم واتساب بحذف الحسابات إذا لم يتم استخدامها وظلت غير نشطة لمدة 120 يوم. ونقصد بعدم نشاط الحساب ألا يتصل المستخدم بحسابه في واتساب.
تجدر الإشارة إلى أنه يلزم توفر اتصال بالإنترنت كي يظل الحساب نشطاً. فإذا كان واتساب مفتوحاً على الهاتف، ولكن المستخدم ليس لديه اتصال بالإنترنت، فهذا يعني أن الحساب غير نشط.
تظل البيانات المحفوظة محلياً على جهاز المستخدم قبل حذف الحساب موجودة حتى يتم حذف تطبيق واتساب من الجهاز. عندما يسجل المستخدم حساب واتساب على نفس الجهاز، تظهر المحتويات المخزنة محلياً على الجهاز مرة أخرى.